Kegiatan Ekstrakulikuler merupakan penopang utama keterampilan para santri dari sisi passion di luar kegiatan akademik, di Asshiddiqiyah 2 tersedia berbagai ekstrakulikuler yang dapat mengasah dan mempertajam daya kreatifitas santri baik olahraga seperti futsal, renang, panahan, berkuda, sepakbola, badminton, taekwondo dan lainnya, muhadharah seperti IKDA dan Qori, keterampilan seperti Paskibra, Pramuka, PMR dan berbagai ekstrakulikuler lainnya.